Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Trpc3Q9QZC1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Trpc3Q9QZC1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Trpc3Q9QZC1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
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Trpc3Q9QZC1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Trpc3Q9QZC1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Trpc3Q9QZC1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Trpc3Q9QZC1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Trpc3Q9QZC1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Trpc3Q9QZC1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc3Q9QZC1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Trpc3Q9QZC1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Trpc3Q9QZC1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Trpc3Q9QZC1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Trpc3Q9QZC1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc3Q9QZC1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc3Q9QZC1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc3Q9QZC1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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