Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx4Q9QY61 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Irx4Q9QY61 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx4Q9QY61 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 753.9 ms