Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cml5Q9QXS8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cml5Q9QXS8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms