Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AatfQ9JKX4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AatfQ9JKX4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AatfQ9JKX4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AatfQ9JKX4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AatfQ9JKX4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AatfQ9JKX4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms