Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Extl1Q9JKV7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Extl1Q9JKV7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms