Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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