Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx6Q9ER75 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irx6Q9ER75 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx6Q9ER75 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms