Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx12Q9ER00 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx12Q9ER00 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms