Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r44Q9EQ47 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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