Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubiad1Q9DC60 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubiad1Q9DC60 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms