Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ergic1Q9DC16 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms