Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms