Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim23Q9DAL0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim23Q9DAL0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms