Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Psmd12Q9D8W5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd12Q9D8W5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd12Q9D8W5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd12Q9D8W5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd12Q9D8W5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd12Q9D8W5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd12Q9D8W5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms