Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8L0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8L0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms