Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4f1Q9D5Q6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Speer4f1Q9D5Q6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Speer4f1Q9D5Q6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms