Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933402E13RikQ9D4D2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933402E13RikQ9D4D2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms