Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OxsmQ9D404 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OxsmQ9D404 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms