Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D1F3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D1F3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1F3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D1F3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D1F3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D1F3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D1F3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D1F3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D1F3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D1F3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms