Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm8Q9CXT6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm8Q9CXT6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm8Q9CXT6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms