Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prkrip1Q9CWV6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms