Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms