Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc96Q9CR92 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc96Q9CR92 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms