Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms