Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms