Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235 ms