Protein–RNA interactions for Protein: Q99P50

Ghsr, Growth hormone secretagogue receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhsrQ99P50 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GhsrQ99P50 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GhsrQ99P50 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms