Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtpbp4Q99ME9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp4Q99ME9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms