Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE1

Rilpl2, RILP-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl2Q99LE1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rilpl2Q99LE1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rilpl2Q99LE1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms