Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TriobpQ99KW3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms