Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ciao1Q99KN2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ciao1Q99KN2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms