Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Reep3Q99KK1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Reep3Q99KK1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms