Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdl1Q923A2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms