Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms