Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usb1Q91W78 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms