Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Mark1Q8VHJ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mark1Q8VHJ5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.5 ms