Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc155Q80VJ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms