Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttll4Q80UG8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttll4Q80UG8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll4Q80UG8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms