Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pja2Q80U04 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pja2Q80U04 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pja2Q80U04 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pja2Q80U04 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pja2Q80U04 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms