Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Syne1Q6ZWR6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms