Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot1Q6ZQ08 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot1Q6ZQ08 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms