Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GmipQ6PGG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GmipQ6PGG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms