Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc82Q6PG04 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc82Q6PG04 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms