Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ecm29Q6PDI5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ecm29Q6PDI5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms