Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbtb40Q6PCS8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbtb40Q6PCS8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms