Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ttbk1Q6PCN3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ttbk1Q6PCN3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
Ttbk1Q6PCN3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ttbk1Q6PCN3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms