Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo4Q6PAQ4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rexo4Q6PAQ4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo4Q6PAQ4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms