Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn11Q6J756 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn11Q6J756 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn11Q6J756 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms