Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otud6aQ6IE21 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6aQ6IE21 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms