Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg9aQ68FE2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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